| 11年 | 3月31日 千勝三喜男校長任期満了にて退任 |
| 4月1日 國學院大學久我山中学・高等学校長に校長代理川福基之氏が就任。中村誠、須崎昭三両副教頭、教頭に就任。高校部長に鈴木慎三教頭、中学部長に中村誠教頭が就任 |
| 4月 8日 名誉校長佐々木周二氏、学校法人國學院大學理事長を辞任し、学校法入國學院大學常任顧問に就任。宇梶輝良氏同理事長に就任 |
| 7月31日～8月16日 高校1年第1回イギリス語学研修（ソールズベリー、ロンドン） |
| 9月25日 創立55周年記念体育祭（中学）開催 |
| 9月 27日 創立55周年記念体育祭（高校）開催 |
| 10月18日 関係物故者慰霊祭挙行 |
| 10月 19日 創立55年記念式典挙行 |
| 11月11日～14日 創立55周年記念美術展三鷹市美術ギャラリーで開催 |
| 11月13日 初のオープンキャンパス実施 |
| 12月河内貴哉君（高校3年）プロ野球ドラフト会議にて広島・中日・近鉄の3球団から1位指名を受け、広島カープに入団 |
| 12年 | 6月15日 「久我山父母の会」発足、第1回総会開催 |
| 6月21日 第40回日米親善高校レスリング大会（ミシガン州代表対東京選抜）が母校第2体育館で開かれる（母校レスリング部からも出場） |
| 7月19日 「國學院大學久我山中学高等学校校報」 第500号発行 |
| 8月8日 高校サッカー部第45回全国高校総合体育大会（インターハイ）準優勝 |
| 8月久我山会結成50周年記念建造物の「時計塔付き守衛所」が正門脇に竣工 |
| 9月1日 「時計塔付き守衛所」 落成式。久我山会より母校に寄贈 |
| 13年 | 1月1日 新世紀2001年1月1日午前零時、久我山会より母校に寄贈した時計塔の再始動式を、母校教職員代表・久我山会代表等が列席し挙行 |
| 1月13日 久我山会結成50周年記念パーティを京王プラザホテルで開催 |
| 2月『久我山春秋』第17号（佐々木周二先生米寿記念特集号）刊行 |
| 5月高校弓道部、ロンドンで開催された「ジャパン2001」の開幕デモンストレーションで演武 |
| 14年 | 1月19日 久我山会新年交歓パーティの会場を、例年の母校よりホテルに変更、以後現在に至る |
| 4月1日 教育組織を男子部、女子部の二部制とし、男子部部長に岡部定征教頭、女子部部長に松原宏臣教頭が就任。授業週5日7校時制、中・高6か年を前期・中期・後期の3課程制を導入する |
| 7月11日 大野文夫教諭病気のため逝去 |
| 8月27日 佐藤三木雄元校長逝去、享年79歳 |
| 8月31日 本館耐震第1期工事竣工 |
| 9月2日～6日 中学3年生、従来の修学旅行に代わる、初の北海道自然体験教室実施 |
| 10月21日 國學院大學附属幼稚園創立50周年記念式典挙行 |
| 11月4日 國學院大學創立120周年記念式典挙行 |
| 15年 | 4月8日 学校法人國學院大學理事に川福基之校長が、同評議員に岡部定征・松原宏臣両教頭が就任 |
| 8月31日 本館耐震第2期工事竣工 |
| 12月1日 阿部美哉國學院大學学長逝去 |
| 12月25日 中学ラグビー部、第23回東日本中学ラグビーフットボール大会で初優勝 |
| 12月25日 高校バスケットボール部、第34回全国高等学校バスケットボール選抜優勝大会でベスト8 |
| 16年 | 4月1日 安蘇谷正彦教授、國學院大學学長に就任 |
| 9月創立60周年記念体育祭（18日 高校、25日 中学） |
| 9月20日 ニュージーランド・オークランドグラマースクールのラグビー部、国際交流のため来日、母校高校ラグビー部と親善試合（武蔵野陸上競技場） |
| 9月24日 理科会館耐震工事竣工 |
| 10月2･3日 創立60周年記念久我山祭 |
| 10月18日 創立60周年関係物故者慰霊祭 |
| 10月 19日創立60周年記念式典挙行 |
| 12月25日 中学ラグビー部、東日本大会2連覇 |
| 12月25日 高校男子バスケットボール部、全国選抜大会ベスト8 |
| 17年 | 1月3日 高校ラグビー部、全国大会ベスト8 |
| 8月7日 高校サッカー部、インターハイベスト8。高校男子バスケットボール部、インターハイベスト16 |
| 8月27日 柔道場解体 |
| 12月26日 中学ラグビー部、東日本大会準優勝 |
| 12月28日 高校男子バスケットボール部、全国選抜大会ベスト8 |
| 18年 | 1月 1日 高校ラグビー部、全国大会ベスト16 |
| 1月16日 第1体育館耐震工事竣工 |
| 4月7日 高校ラグビー部、全国選抜大会ベスト4 |
| 6月22日 小林實元校長病気のため逝去、享年78歳 |
| 8月6日 高校サッカー部、インターハイ2年連続ベスト8 |
| 12月26日 中学ラグビー部、東日本大会2年ぶり3回目の優勝 |
| 19年 | 1月1日 高校ラグビー部、全国大会ベスト8 |
| 4月5月 高校ラグビー部、全国選抜大会ベスト8 |
| 10月高校サッカー部、秋田国体サッカー少年男子の部に東京チームの主将･メンバーとして出場し優勝 |
| 10月28日 中学音楽部、全国合唱コンクール3位 |
| 11月4日 國學院大學創立125周年記念式典挙行 |
| 20年 | 1月3日 高校ラグビー部、全国大会ベスト16 |
| 3月29日 新校舎学習センター竣工 |
| 4月6日 高校ラグビー部、全国選抜大会ベスト4 |
| 4月23日 高校人工芝グラウンド完成 |
| 12月25日 中学ラグビー部、東日本大会2年ぶり4回目の優勝 |
